README - APL (Aire Par Lipide) M1BI Dynamique Moléculaire - 2024

M1BI : Dounia BENYAKHLAF (22007439) et Louise LAM (21980795)
Référente : Maya ZYGADLO

Pour commencer

Ces instructions vont vous permettre d’obtenir une version fonctionnelle de notre projet, APL, sur votre machine locale. Lisez les instructions suivantes pour une expérience optimale.

Prérequis

Ce projet a été testé avec Python 3.11.7 et les packages MDAnalysis 2.4.3, Scipy 1.10.1 et Shapely 2.0.1. L’installation de ces versions, au minimum, est recommandée pour pouvoir lancer le projet correctement.

Installation

1. Désarchiver le projet

tar -xvf ProjetAPL_BENYAKHLAF-LAM.tar.gz

2. Se placer dans le répertoire du projet :

cd md-apl

3. Activer son environnement Python. Par exemple avec conda :

conda activate mon_environnement

4. Puis, lancer la commande suivante :

python src/scripts/apl.py

Voir le fichier RAPPORT pour plus d’informations concernant la construction du projet.